Nhóm khủng bố Haqqani Network bắt đầu xuất hiện trong các báo cáo của các cơ quan tình báo hoạt động ở Afghanistan và Pakistan từ năm 2004-2005. Tên của mạng lưới gắn liền với tên của chỉ huy chiến trường Jalaluddin Haqqani, người đã chiến đấu chống lại quân đội Liên Xô.
Trong thời gian quân đội Liên Xô ở Afghanistan, Jalaluddin Haqqani là một chỉ huy chiến trường nổi tiếng, ông được Cục Tình báo Trung ương Mỹ ủng hộ, hỗ trợ tài chính.
Sau khi quân đội Liên Xô rút đi, cuộc nội chiến ở Afghanistan vẫn tiếp tục. Haqqani đã tham gia vào một số hoạt động lớn, quyền hạn của anh ấy đã tăng lên đáng kể. Năm 1992, ông tham gia đàm phán hòa bình giữa các bên tham chiến, sau đó trở thành Bộ trưởng Bộ Tư pháp Afghanistan và giữ chức vụ này trong 4 năm.
Sau khi Taliban chiếm Kabul vào năm 1996, Haqqani đào tẩu sang phe của họ và được bổ nhiệm làm Bộ trưởng Bộ Các vấn đề Biên giới. Trên thực tế, điều này dẫn đến việc ông ta kiểm soát hoàn toàn tỉnh Paktia, nơi đặt các trại huấn luyện của al-Qaeda mà sau đó đã bị người Mỹ phá hủy. Sau khi Hoa Kỳ bắt đầu chiến dịch chống lại Taliban, Haqqani bắt đầu chỉ huy các lực lượng vũ trang của họ, nhưng không thể chống lại những kẻ xâm lược. Taliban bị đánh bại, Haqqani bắt đầu tiến hành chiến tranh du kích và nhanh chóng bị người Mỹ xếp vào danh sách 6 tên khủng bố bị truy nã gắt gao nhất của Taliban.
Các hành động của Haqqani chống lại lực lượng chính phủ và quân đội Mỹ rất thành công, kể từ giữa những năm 2000, các báo cáo từ Afghanistan bắt đầu đề cập đến "Mạng lưới Haqqani", chỉ ra ảnh hưởng ngày càng tăng của lãnh chúa này. Kể từ năm 2006, cùng với Haqqani, con trai của ông là Sirajuddin (Siraj) đã phụ trách mạng lưới. Kể từ năm 2007, Siraj là người cai trị tập đoàn vì tình trạng sức khỏe ngày càng giảm sút của cha mình. Liên kết chặt chẽ với Taliban, nhóm khủng bố Haqqani tuy nhiên hoạt động độc lập và không bao giờ chịu khuất phục trước bất kỳ ai.
Chẳng bao lâu, ban lãnh đạo của "Mạng lưới Haqqani" đã bao gồm một số thành viên trong gia đình của người sáng lập nó và một số chỉ huy hiện trường, nhóm đã kiểm soát một số tỉnh của Afghanistan. Từ năm 2008, nhóm này bắt đầu sử dụng những kẻ đánh bom liều chết để thực hiện các cuộc tấn công khủng bố, chính quyền Mỹ bắt đầu coi đây là mối đe dọa lớn nhất đối với quân đội Mỹ ở Afghanistan. Theo các cơ quan tình báo, số lượng thành viên của mạng lưới năm 2010 dao động từ 4 đến 15 nghìn người. Rất khó để ước tính chính xác hơn số lượng chiến binh do tính chất khép kín của nhóm.
Từ năm 2008, con trai của người sáng lập tập đoàn, Siraj Haqqani, đã bị Hoa Kỳ đưa vào danh sách khủng bố; từ năm 2009, phần thưởng trị giá 5 triệu USD đã được công bố cho thông tin về anh ta. Trong những năm sau đó, Nasiruddin Haqqani, Khalil al-Rahman Haqqani và Badruddin Haqqani đã được thêm vào danh sách khủng bố.
Trong một thời gian dài, các nhà chức trách Mỹ không dám chính thức đưa "Mạng lưới Haqqani" vào số lượng các nhóm khủng bố, vì họ vẫn hy vọng đi đến một thỏa thuận với những người đứng đầu một phong trào có ảnh hưởng như vậy. Các cơ quan tình báo của nước này thậm chí còn tổ chức các cuộc họp với các đại diện của mạng lưới, nhưng họ không đạt được bất kỳ thỏa thuận nào.
Tình hình cuối cùng đã được giải tỏa vào tháng 9 năm 2011, khi những kẻ khủng bố từ Mạng lưới Haqqani tấn công trụ sở lực lượng NATO và đại sứ quán Mỹ ở Kabul. 16 người đã trở thành nạn nhân của vụ tấn công. Rõ ràng là không thể đạt được thỏa thuận với những kẻ khủng bố, và vào tháng 9 năm 2012, có thông báo rằng Hoa Kỳ đã bổ sung Mạng lưới Haqqani vào danh sách các nhóm khủng bố.
